一、實驗室常用核酸的濃度與純度檢測
核酸濃度與純度檢測最簡單常用的儀器是微量紫外分光光度計,代表為NanoDrop。NanoDrop分光光度計利用分子的紫外吸收特性來測定樣品濃度。核酸吸收峰為260nm,蛋白樣品吸收峰為280nm。此外,很多提取過程中殘留的污染物通常在280nm和230nm處有吸收峰。[ NanoDrop Spectrophotometer Resources | Thermo Fisher Scientific - CN]樣品濃度與吸光度成正比關(guān)系(Beer-Lambert Law),因此通過測定吸收峰就可以得出核酸樣品的濃度。
核酸樣品的純度可以由A260/A280、A260/A230兩個比值來反應(yīng)。純度較高DNA的A260/A280應(yīng)在1.8左右,RNA在2.0左右。若DNA樣品的A260/A280數(shù)值偏向2.0,則表明存在RNA污染,如有需要應(yīng)使用RNA酶處理樣品并純化,反之亦然。A260/A230數(shù)值可以反應(yīng)樣品中有機物污染水平,一般大于2.0則較好,若偏低則表示產(chǎn)物中含胍或乙醇等有機物的污染(如表1所示)。
比值 | 測定樣品 | “純”樣品的比值范圍 | 比值異常的原因 |
A260/A280 | 核酸 | DNA: ~1.8 RNA: ~2.0 | 造成低比值的污染物: -蛋白質(zhì) -核酸提取步驟中的殘余苯酚和其他試劑 |
A260/A230 | 核酸 | DNA/RNA: ~2.0-2.2 | 造成低比值的污染物: -蛋白質(zhì) -碳水化合物 -提取中的殘余苯酚 -殘余胍(常見于提取柱類方法) -用作輔助沉淀劑的糖原 造成高比值的原因: -空白對照有誤 |
A260/A280 | 蛋白 | ~0.6 | 造成高比值的污染物: -核酸 |